Basado en http://www.itmovil.com/2012/04/25/cerrar-todas-las-conexiones-de-un-usuario-en-mysql/
Abrir conexión por el cliente de consola de MySQL/MariaDB:
mysql -u root -p
luego creamos dinamicamente todas las sentencias para todos los procesos activos de un determinado usuario y lo guardamos en un archivo del disco duro, para ello ejecutamos :
select concat('KILL ',id,';') from information_schema.processlist where user='usuariodb' into outfile '/tmp/a.txt';
Ahora lo único que se debe hacer es ejecutar el archivo de texto que contiene las instrucciones, para ello ejecutamos
source /tmp/a.txt;
That's all..
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